第15集
英萊質問春紅自己到底是誰，春紅表示絕不能讓陳赫知道此事。陳赫、景卓急切的找著失蹤的英萊，陳赫決定要為英萊做手術。春紅勸說英萊要隱藏真相，那樣陳赫才可以回到未來，英萊黯然離開。英萊請求神父收留她。
左相因婚事未成，遷怒英萊及其母親，要將他們貶為官奴；景卓被迫說出英萊有病之事，暫時穩住形勢。李昰應開始主持編撰王室宗譜。英徽找到李昰應，表示決定投靠他。李昰應集結宗親，提出罷免左相。陳赫找到春紅欲打聽英萊的下落，春紅苦勸無果。為掩護隱藏著的神父與英萊，一名小孩受傷，英萊為其縫合傷口。陳赫終找到英萊，決意要為其動手術；春紅得知此事，十分著急。
左相決定派景卓去制止宗親集結，英徽使計，讓周八假扮安東金氏的人為左相說話，反激起宗親罷相士氣。大妃、主上欲罷免左相之職，歸來的左相對景卓大發雷霆。春紅找到景卓，向其透露了英萊行蹤，景卓緊急趕來。陳赫、許醫員為英萊做手術，即將縫合之時，陳赫卻突遇當日那種頭痛，導致英萊大出血，幸許醫員救治才轉危為安。
左相借英徽逆賊之名，抓捕了他的母親，陳赫得知後請求李昰應幫忙。景卓表示一定要與英萊結婚，並準備強行帶走她，陳赫阻止，景卓離開。英徽求李昰應救自己的母親，李昰應前來找左相，以銷毀左相貪污證據及召回金大鈞為條件，終與左相達成交易。
陳赫送英萊回家，英萊母親已知兒子死訊，與英萊抱頭痛哭。左相得勢，景卓被罷職及逐出家門；景卓硬闖進屋詢問緣由，左相遂逼迫景卓去射殺李昰應。陳赫感謝李昰應救出英萊母親之際，李昰應中槍倒下。
第16集
李昰應中槍，英徽、周八前去追蹤兇手。英徽與景卓交戰，彼此認出對方，景卓大為驚訝。陳赫將李昰應帶至春紅處救治，春紅為其輸血；周八將景卓打暈帶走。被貶的金大鈞回到家中。陳赫偶然發現英萊信奉天主教。春紅依舊勸說陳赫不要違背歷史。周八痛打抓回的景卓，逼問他幕後主謀，卻反遭景卓恥笑。
陳赫被召入宮，卻被御醫阻撓而未成功診治主上。歸來的路上，陳赫撕毀了剿滅天主教徒的榜文，此時突然遇到頭痛狀況。李昰應突然心跳停止，陳赫趕來為其急救，頭痛狀況又在出現。李昰應醒來，陳赫向他道出自己來自於未來的事實。
英徽來見景卓，告訴他李昰應得到救治的事情；英徽拉攏景卓一同去打破舊格局，景卓恥笑英徽紙上談兵。英萊意外得知是景卓開槍打傷了李昰應。李昰應向陳赫打聽歷史的發展趨勢，陳赫說出李昰應未來將處死眾多天主教徒，李昰應與陳赫約定，絕不會處死天主教徒。
英萊逼問周八終得知景卓被關之地，遂即刻前來。主上病危，陳赫束手無策，李昰應進宮拜見。英萊再次前來欲救景卓，景卓卻已逃走。哲宗離世，在後嗣確立問題上，左相與李昰應針鋒相對。景卓來到舊居，回憶著小時候的自己，決心自盡，英萊趕來阻止。
李昰應約見左相，欲用權勢為條件讓左相幫助命福獲得王位，左相本不為所動；李昰應拿出他欲加害宗親的證據，終逼左相就範。陳赫因反覆頭痛終昏倒。深夜雨中，景卓跪拜在左相府門口。陳赫醒來，春紅向他道出，他沒改變一次歷史，腦中的腫瘤將長大一次，陳赫震驚；春紅請求陳赫勿再攪亂歷史，否則他將永久泯滅。
大妃娘娘面前，左相與李昰應針對王位後嗣問題得出統一結論，共同推選命福為王。左相饒過景卓，還首次破例讓景卓稱呼自己為父親。陳赫頭痛加劇，自感不久將回到未來。